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2016年获批药学硕士专业学位授权点，2017年开始独立招生。结合我校药学学科现状，药学硕士专业学位研究生分为临床药学和工业药学2个专业领域。
临床药学培养定位于药物临床使用和监管的服务与研究，通过系统的临床药学专业学习和实践，培养既懂药学专业知识、了解药物性质和临床疗效，又熟悉相关疾病特点和治疗要求，掌握临床药学管理方法、实践过程和学科进展的高层次应用型专业人才。能为患者提供个体化治疗的药学服务，能指导患者安全、有效、经济、合理用药；能运用临床药学理论与实践知识从临床实践中发现问题，并拓展应用型研究，为今后承担医疗机构临床药学技术工作打下坚实的基础。
工业药学培养定位于培养能够促使科研成果转化，具有生产技术革新能力的高层次应用型专业人才。了解国家药品开发和知识产权相关政策、法规及管理制度，熟悉药品生产工艺和新药审批流程，掌握药物制剂开发和工艺设计、制剂技术改进和质量控制、中药饮片加工、中药材质量控制、市场销售、数据与资料的整理和撰写，能在科研机构、医药企业及相关院所从事新药研发、药品制造和技术转化、管理等工作。
